Pour choisir une pompe adéquate et efficace, il est important de prendre en compte différents critères lors de l’acquisition. Le débit est proportionnel au volume de l'aquarium : il doit ainsi être au minimum par heure de 3 fois le volume d'eau contenue dans l'aquarium, et jusqu'à 10 fois celui-ci. Le volume du filtre est également important, car plus il est grand, plus la filtration sera efficace. La consommation est un autre facteur à considérer, car la pompe sera en marche continuellement, il est donc préférable de choisir celle avec la consommation la plus réduite. Le niveau sonore est également important, car les poissons sont très sensibles au bruit, il est donc préférable de choisir la pompe la plus silencieuse. Il existe plusieurs types de pompes d'aquarium, notamment la pompe de refoulement, la pompe de brassage, la pompe silencieuse et la pompe externe. Afin de profiter au maximum de vos poissons et pour garder une eau impeccable, il est conseillé une petite pompe à refoulement silencieuse d'un débit minimum de 100 litres/heure. La pompe de brassage n'est pas indispensable, sauf s'il s'agit d'eau de mer. Pour un aquarium de 120 litres, la pompe de brassage est fortement recommandée, même pour de l'eau douce. Pour un aquarium de 240 litres, il est indispensable de s'équiper des 2 pompes pour offrir une bonne qualité d'eau aux poissons, plantes ou crustacés.